流體進入蠕動泵耐酸堿后，儲存在兩個滾輪之間，形成“流體枕”。隨后便是短暫的斷流，因為后面的一段蠕動泵管又被輥子阻斷，又形成了一個“流體枕”。在這個循環中，形成脈動而不是平滑的連續流體。
如果不想出現這種脈動，可以使用蠕動泵耐酸堿管鎖緊度可調的蠕動泵頭，這樣可以降低25%的脈動度，因為它減緩了液枕之間的斷開程度。但在某些應用中，蠕動泵產生的脈動受到更嚴格的限制。對他們來說，減少25%的脈動是不夠的。在這種情況下，可以考慮其他四種措施來進一步減少脈動：蠕動泵頭形狀，交錯鎖定和更多滾子；采用多蠕動泵頭錯開脈動形式；采用脈動緩沖器；并更換排放管的配置。定時還要求，當滾輪位于蠕動泵頭的上止點（TDC）時，鎖緊度剛好為最大值。但是有的蠕動泵頭配備了六到八個滾輪，在設計中還加入了交錯鎖緊——即在鎖緊度最大時，滾輪已經轉離蠕動泵頭的上死點，這兩種設計的組合可用于消除脈動。
兩個具有交錯鎖定的蠕動泵管夾（或蠕動泵管床）可以直接安裝在蠕動泵頭的不同方向上，可以使兩個蠕動泵管床中的蠕動泵管交替達到最大鎖定度，并且滾子就在上止點的對面。三通接頭用于將入口分成兩個通道，三通接頭用于在出口處將兩個通道組合在一起。這允許流體脈動交替到達出口處的三通接頭。由于安裝了六到八個滾輪，因此液枕中的體積幾乎與截止時的體積相同。這樣，一個通道中的每個液枕就可以剛好填充另一個通道中的截斷部分。由于增加了滾子，流體脈動頻率增加而幅度減小。這樣，脈動就可以基本消除。這種方法特別適用于流速小于460ml/min的流體。
對于流速超過460毫升/分鐘的流體，也可以安裝兩個交錯鎖定的蠕動泵耐酸堿管夾（或蠕動泵管床），雖然效果稍差一些。兩個蠕動泵頭可以并聯。兩個蠕動泵頭設計如下：當滾輪位于蠕動泵頭的上止點（TDC）時，鎖緊度剛好最大；然而，兩個轉子的旋轉位置需要彼此錯開。當蠕動泵頭位置的錯開距離達到滾柱距離的50%時，效果比較好。在這種配置中，滾子不會同時到達上止點，因此流體枕和截止將在兩個相鄰通道之間交替。如果各通道的進出口端采用三通連接，則一個通道內的液枕剛好能填滿另一通道出口處的截斷部分。但是，這種蠕動泵頭產生的液枕和截止部分的體積比大于六到八個滾子的蠕動泵頭產生的體積比。這樣相鄰通道的多個液枕會相互重疊，脈動度只能降低80-95%。
